膜污染是膜與管式反應器內的污泥混合液中的污染成分相互影響而導致的在膜孔內或是膜面吸咐、集聚、沉積等，進而造成膜跨膜工作壓力的上升（恒流電源方式）或是膜通量的減少（恒壓方式）的狀況。

活力污泥管理體系中成分諸多，包含廢水栽培基質、產甲烷菌、微生物菌種體細胞、體細胞殘片及其微生物菌種新陳代謝物質如胞外高聚物（EPS）和溶解度微生物菌種物質（SMP）及其各種各樣有機化學、有機物溶解度成分等，理論上講每一部分對膜污染都是有奉獻。

活力污泥管理體系中的成分在膜孔內的粘附和集聚產生的污染，稱作內部污染；而在膜表層集聚或堆積產生的污染稱作外界污染。

必須強調的是，MBR膜的外界污染中存有"泥餅層"污染和"疑膠層"污染的狀況。泥餅層污染就是指很多污泥絮體在膜面堆積而產生的污染；疑膠層污染則是一些小顆粒成分，如膠體溶液成分、EPS、SMP等成分在膜面的粘附和集聚，這種成分的粒度遍布通常比較廣泛，良好控制這種成分沒有膜面堆積是不太可能的。

在MBR運作環節中，一旦發生泥餅層的污染，系統軟件隨著會發生工作壓力快速升高或是通量大幅度衰減系數的狀況，MBR短時間做到運作終點站，必須開展膜的清理。而目，在長期性運作環節中，這種被覺得"可逆性"的泥餅層污染會慢慢向"不可逆"銜接，危害系統軟件的長久平穩運作。

雖然有學者覺得泥餅層污染可以具有阻攔細微細顆粒物等的功效，可是一般在MBR實際操作運作時要盡量防止泥餅層的銜接產生。疑膠層污染所產生的是膜污染摩擦阻力遲緩升高的全過程，在恒流電源實際操作方式中主要表現為工作壓力的遲緩升高，在恒壓實際操作方式中主要表現為通量的遲緩衰減系數。

除此之外，現階段有關MBR中優點污染物的科學研究與了解仍存有異議，可是一般覺得管式反應器中具有的膠體溶液成分和微生物菌種物質是造成MBR長期性運作環節中污染的關鍵污染物，而且有機物正離子與有機化合物中間出現的鐵路橋和絡合作用會造成更為比較嚴重的污染狀況。

在MBR中，膜污染與膜原材料、污泥混合液特性及其控制運轉標準等三部分有關。因而，MBR的膜污染操縱也關鍵集中化于以上三層面，即性能卓越膜原材料/膜部件研制開發、污泥混合液特性管控和實際操作運轉標準提升。

膜原材料和膜部件是MBR及其別的膜分離技術加工工藝的關鍵，是危害膜分離技術加工工藝中膜污染的主要因素之一。選用性能卓越、抗污染的膜原材料和膜部件是合理操縱膜污染的立即、合理的方式。因而，現階段市場上產生了多種多樣材料、各種各樣膜部件的膜商品。從膜原材料來講，膜孔，徑、親/疏水性、Zeta電位差、膜面表面粗糙度及其膜面官能團異構狀況等均會對膜污染導致危害。

在性能卓越膜原材料制取全過程中，必須充分考慮膜面每個物理學性能參數的危害。現階段，膜原材料使用性能的改進包含膜面改性材料與膜本身改性材料二種方式。

具體來說，又包含：

①吸水性改進，如等離子解決、藥物泡浸-干化等；

②抗污染因素加上或熱聚合，如加上作用洗潔劑因素、納米復合材料、表層紫外線照/y光直射熱聚合等；

③膜面正電荷裝飾；

④膜直徑、孔隙率、表面粗糙度等改進。一般而言，MBR中膜原材料期待具備吸水性強、負電荷高朝、直徑遍布勻稱、表面粗糙度低的特性。

此外，值得一提的是一些便宜板材，如無防布、篩絹、不銹鋼篩網、滌綸網等可以運用在板材上產生動態性膜開展過慮分離出來，不但得到了較好的剝離實際效果，與此同時可以防止傳統式膜污染比較嚴重的問題，這種膜板材的清理也十分便捷。自然，膜部件及其膜組器的優化對合理操縱膜污染也很重要。

混合液特性是危害膜污染的另一關鍵要素，包括污泥濃度值、污泥成份（纖維成分、膠體溶液、溶解度成分、SMP、EPS、有機物正離子等）、污泥粒度、污泥粘稠度、污泥有益菌等。混合液特性與膜污染中間的關系十分復雜，且科學研究結果存有著一定的異議和分歧之處。